Salut !!
La conception "in silico" est une conception de novo par criblage vrituel de chimiothèques, on va cribler virtuellement (grâce à un calculateur) des molécules sur une cible.
Dans le cadre de la modélisation moléculaire, on peut bien parler de conception "in silico" pour la méthode directe et la méthode indirecte, la différence va être le fait que l'on dispose ou non de la structure de la cible.
Quand on connaît déjà la structure de la cible grâce aux rayons X ou à la RMN, on parle de méthode directe et on va donc pouvoir tester directement nos molécules sur la cible mais lorsque l'on a pas accès à la structure de la cible mais qu'on sait que certaines molécules marchent sur cette cible, on va chercher le point commun entre ces molécules afin de trouver le pharmacophore, on parle alors de méthode indirecte. Toujours virtuellement.
J'espère que j'ai répondu à ta question, bon courage !!