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Liste des remarques et errata du tut' Bioch 2018

Posté : 13 août 2018, 23:50
par Arty
[EDIT : les errata les plus récents sont en vert pour bien les voir]

Bien le bonjour!

En ma qualité de Responsable Publi du tut' Bioch 2018, j'ouvre ce sujet dans lequel seront rassemblées toutes les infos pour la mise à jour durant l'été 2019 :idea:


MERCI de ne PAS commenter en-dessous, et de créer un nouveau sujet pour chaque nouvel erratum (ou nouvelle idée)


Voici déjà quelques idées et remarques pour les futurs RPs :
- il faudrait une vraie mise à jour du lexique cette année, car pas vraiment eu en 2018
- une idée des années précédentes est de créer un lexique spécial enzymes du tut'
- les QCMs supplémentaires de Lisa, qui ne sont pas présents dans tous les fichiers séparés que vous aurez, peuvent être rajoutés pour plus d'entraînement (il faudra penser à les mettre à jour et corriger)
- la mise en page des chapitres séparés a connu des jours meilleurs, il faut voir le word du tut' entier plutôt!
- A rajouter dans les chapitres concernés : "l’ensemble des fonctions du vivant peut être construit à partir de 4 types de briques : les acides aminés, les acides nucléiques, les acides gras et les oses."
- Essayer de changer les images qui ne sont plus nettes (au fil des modifications), voire trop floues
- p. 229, le mot oligoside est marqué mais plus utilisé dans le cours, il trouble un peu les p1, à remplacer !


Voici la liste des errata (mille excuses :roll: )

Dans le chapitre sur les Protéines
- p. 16, il est écrit dans le tut' que "on centrifuge à différentes vitesses (centrifugation « différentielle ») pendant des durées croissantes (on obtient une sédimentation par densité croissante)". OR, c'est l'inverse : on obtient une sédimentation par densité décroissante (en effet, le ribosome est moins dense que la cellule en entière)
- p. 29, il manque dans les acides aminés essentiels l'Histidine. Le moyen mnémotechnique en entier est : Hystérique, Le très lyrique Tristan fait vachement méditer Iseult
- p. 38, petite confusion au niveau des oxydations du fer.

Pour la myoglobine, on a deux formes :
- avec Fe2+, c'est la ferromyoglobine
- avec Fe3+, c'est la ferrimyoglobine

Pour l'hémoglobine, on a :
- avec Fe2+, c'est la ferrohémoglobine
- avec Fe3+, c'est la ferrihémoglobine aussi appelée la méthémoglobine

- p. 60/73, pour le QCM 4, l'item B : "La protéine d’intérêt est retenue sur les billes par des liaisons fortes, lors d’une chromatographie par affinité." est corrigé vrai. Or, comme précisé p. 20, il est faux : les protéines s’y fixent par liaisons non covalentes (faible).
- p. 61/74, pour le QCM 5, l'item A : "Les protéines qui sortiront en premier sont chargées positivement." est corrigé vrai mais marqué faux : il est bien vrai, la correction est la bonne
- p. 67/81, pour le QCM 27 : attention, lorsque le peptide est chargé +, il est attiré vers le - (et inversement, quand -, vers +). Le QCM est résolu à l'envers, et le bilan des réponses est donc AD. Pour la correction détaillée, la voici :
"A. VRAI. Peptide neutre donc au centre (zone b)
B. FAUX. Positif donc vers le - (zone a)
C. FAUX. Négatif donc vers + (zone c)
D. VRAI. Positif donc vers - (zone a)
E. FAUX. Neutre donc centre (zone b)"


Dans le chapitre sur l'Enzymologie
- p. 104, dans le formulaire, pour Km : Km correspond à une concentration de substrat [S], et est la valeur de cette concentration pour V0 = Vmax / 2. On a d'ailleurs f(Km) = Vmax / 2 (ça peut paraitre compliqué mais c'est juste ce qu'il y a quand on regarde le graphe p. 90)
- p. 108, les items A et B doivent être : A. 2 000 mol/L B. 0,2 mol/L



Dans le chapitre sur la Biologie Molécualire
- p. 128, c'est trois (3) milliards de paires de base
- p. 164, QCM 11 Item C : il est bien faux, mais c'est le PETIT sillon !
- p. 169, QCM 27 item D : il est FAUX (et pas vrai), car pour la réplication du télomère (qui est de l'ADN), on utilise les ADN polymérases (pas les ARN polymérases)


Dans le chapitre sur les Oses
- p. 218, énorme cafouillage sur les oses. Le glucose et le fructose sont totalement inversés !!! (faites attention, il suffit de les remettre dans le bon ordre)
Voici un glucose :
glucose02.png
Voici un fructose :
D-fructose.gif
Pour le galactose n'en parlons même, je ne comprends même pas comment ce truc ignoble est arrivé là. Voici un galactose :
galactose02.png
- p. 229, dans le tableau récap, attention : la liaison dans du lactose c'est du BETA 1 - 4
- p. 234, QCM 19 : il faut échanger les molécules A et B (la A devient la B et vice versa) pour que la correction soit bonne !


Dans le chapitre sur les Lipides
- p. 188, dans le tableau, à la ligne des bases : la phosphorylcholine présentée est une choline tout court ! La phosphorylcholine, c'est pareil mais avec un groupement phosphate à la place du OH
- p. 208, dans la correction rapide, pour le QCM 21, il manque l'item E (réponses vraies : BE). La correction détaillée est juste
- p. 200, QCM 13, item D : il manque dans l'énoncé le mot diphosphate (et l'item est alors bien vrai)
- p. 211, QCM 14, item B : il est vrai (et non pas faux), comme le dit la correction et l'item


Dans le chapitre sur le Métabolisme énergétique
- p. 248, le schéma bilan est bon, mais ne tient pas compte du caractère réversible ou irréversible de chaque étape. Ne pas oublier : Étapes irréversibles (très exergoniques) : 1, 3 et 10. Le plus simple est que vous rajoutiez des doubles flèches directement sur le tut' pour les étapes 2, 4, 5, 6, 7, 8 et 9 !
- p. 252, dans le tableau, partie navette glycéro-phosphate, il manque dans la première équation le NAD+ qui n'est pas passé, soit au final : "DHAP + NADH, H+ (cytosol) ↔ Glycerol Phosphate + NAD+"


Dans le chapitre sur le Métabolisme glucido-lipidique
- p. 326, il y a une inversion des chiffres dans la deuxième ligne, case de gauche, du tableau : il faut 7 acétyl-CoA qui donnent 7 malonyl CoA + 1 acétyl CoA initial + 14 NADPH, H+ pour former le palmitate !



N'hésitez pas à contacter Lina ou moi-même (Arty sur le forum), si besoin :roll:

Re: Liste des remarques et errata du tut' Bioch 2018

Posté : 16 septembre 2018, 20:27
par ephoris
(oui je crée pas de nouveau topic, je suis un thug)

L'histidine n'est AA essentiel que chez l'enfant :) (tout comme l'arginine qui n'est pas mentionnée)

Re: Liste des remarques et errata du tut' Bioch 2018

Posté : 16 septembre 2018, 21:08
par Arty
Yes, je le sais bien, mais ça reste dans la liste des AA essentiels du cours de Carrié, même si c'est que chez l'enfant, donc à connaître

Ton message s'auto-détruira dans 48h, c'est la sentence quand on ne respecte pas la règle de création d'un nouveau sujet et qu'on est un thug :twisted: :twisted: