Cours de biomol dans le tuts

[Anissa]

Coucou, dans le cours on nous dit que :
• La transcription commence au site d’initiation à la transcription, c’est à dire au début de l’exon1
environ 25 nucléotides après la boîte TATA sur le brin sens. Le démarrage de la synthèse se fait à
partir de 2 ribonucléotides complémentaire des 2 premiers nucléotides du brin antisens.
Remarque : Le 1er nucléotide conserve donc ses 3 phosphates, on dit donc que le 1er nucléotide du transcrit
primaire est un nucléoside triphosphate

Mais ce que je comprends pas c'est pourquoi est-ce que la synthèse commence à partir de 2 rubonucléotides ? ça commence forcement par un nucléotide et ensuite ça continue au fur et à mesure non ? Et pourquoi est-ce qu'on en déduit que du coup le 1er nucléotide a 3 phosphates ?

Je suis un peu perdue haha

[Lamice]

Re-coucou Anissa (eh oui c'est encore moi)

On sait que l'ARN polymérase II est utilisé lors de la transcription pour la polymérisation du transcrit primaire.
Mais concrètement qu'est ce qu'elle fait ? Elle sert à créer la liaison phosphodiester qui lie 2 nucléotides entre eux sur le brin.

Pour cela, on sait qu'on a besoin d'énergie en hydrolysant (cassant) des liaisons riches en énergie: les liaisons anhydrides phosphoriques (entre les phosphates).
La réaction exergonique (libérant de l'énergie) est XTP --> XMP + PPi. ("X" étant n'importe quelle base : U, A, C ou G).

Donc pour que l'ARN polymérise II puisse exercer sa fonction (créer la liaison phosphodiester) il lui faut:

- du Mg2+ dans son milieu ainsi que le brin anti-sens pour la complémentarité.
- 2 Ribonuclétotides (si on en avait qu'un seul on ne pourrait rien lier du tout logique).
- Enfin, l'hydrolyse de 2 liaisons riches en énergie. Or on a 2 bases tri-phosphates. On va pas hydrolyser et libérer plus d'énergie que ce dont on a besoin. On ne touche pas au premier nucléotide qui reste tri-phosphate. Et on hydrolyse 2 liaisons anhydrides phosphoriques du 2ème ribonucléotide libérant ses 2 phosphates.
Puis le 3ème ribonucléotide sera lié au deuxième donc on hydrolyse ses liaisons aussi et ainsi de suite. On hydrolyse les 2 liaisons a chaque nouveau nucléotide qu'on rajoute par la suite.

C'est pour ça qu'on a besoin de 2 ribonucléotides et que le premier du transcrit primaire est le seul a rester tri-phosphate.

J'espère avoir bien pu t'expliquer mais si tu as besoin de précision n'hésite pas !

[Anissa]

Re-coucou Anissa (eh oui c'est encore moi)

On sait que l'ARN polymérase II est utilisé lors de la transcription pour la polymérisation du transcrit primaire.
Mais concrètement qu'est ce qu'elle fait ? Elle sert à créer la liaison phosphodiester qui lie 2 nucléotides entre eux sur le brin.

Pour cela, on sait qu'on a besoin d'énergie en hydrolysant (cassant) des liaisons riches en énergie: les liaisons anhydrides phosphoriques (entre les phosphates).
La réaction exergonique (libérant de l'énergie) est XTP --> XMP + PPi. ("X" étant n'importe quelle base : U, A, C ou G).

Donc pour que l'ARN polymérise II puisse exercer sa fonction (créer la liaison phosphodiester) il lui faut:

- du Mg2+ dans son milieu ainsi que le brin anti-sens pour la complémentarité.
- 2 Ribonuclétotides (si on en avait qu'un seul on ne pourrait rien lier du tout logique).
- Enfin, l'hydrolyse de 2 liaisons riches en énergie. Or on a 2 bases tri-phosphates. On va pas hydrolyser et libérer plus d'énergie que ce dont on a besoin. On ne touche pas au premier nucléotide qui reste tri-phosphate. Et on hydrolyse 2 liaisons anhydrides phosphoriques du 2ème ribonucléotide libérant ses 2 phosphates.
Puis le 3ème ribonucléotide sera lié au deuxième donc on hydrolyse ses liaisons aussi et ainsi de suite. On hydrolyse les 2 liaisons a chaque nouveau nucléotide qu'on rajoute par la suite.

C'est pour ça qu'on a besoin de 2 ribonucléotides et que le premier du transcrit primaire est le seul a rester tri-phosphate.

J'espère avoir bien pu t'expliquer mais si tu as besoin de précision n'hésite pas !

Merci beaucoup encore une fois haha ça m'aide vraiment !