charge d'une protéine

[Isma95]

Coucou,
J'ai une question par rapport aux charges d'une prot. Si on veut determiner la charge d'une prot on regarde si y a un aa ionisable donc jusque la ca va. Mais j'aimerais savoir si les autres classes d'aa (exemple alliphatiques avec leur COO- à pH=7) interviennent dans la détermination de la charge d'une prot. Par ailleurs je comprends pas la diff entre protoné et déprotoné par rapport au pH et pKa?

merciiii

[Soline]

Hello,

Au premier semestre on prend uniquement en compte la charge de la chaîne latérale, donc les aa non ionisables n'interviennent pas
Pour ta deuxième question, ça va dépendre des aa. Par exemple, lorsque l'acide glutamique qui est négatif gagne un proton, il devient neutre (si tu rajoutes un H+ à qqch chargé -, ça te donne du neutre). Lorsque les aa basiques, chargés +, perdent un proton, ils deviennent neutre (et non pas chargés -). Pour faire simple, retiens ça :
AA acides : neutres si pH<pKa, négatifs si pH>pKa
AA basiques : positifs si pH<pKa, neutres si pH>pKa