Charge acide aminé

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le.roi.singe

Re: Charge acide aminé

Message par le.roi.singe »

Bonjour
Haterind a écrit : 31 août 2020, 11:00 Si tu veux un exemple à faire tu peux essayer de trouver la charge globale de la chaîne suivante de la façon que tu veux :D (dans une solution avec un pH = 5) :[/i]
Glu - Met - Leu - Phe - Pro - Lys - Arg - Asp - Ser - Gln - Gln - His
Voici ma tentative de réponse :

Les AA qui nous intéressent sont en gras.
Glu - Met - Leu - Phe - Pro - Lys - Arg - Asp - Ser - Gln - Gln - His

Nous sommes à pH = 5, on place le trait dans le tableau :
exercice.png
L'acide glutamique est négatif à ce pH.
La lysine et l'arginine son positifs.
L''histidine est neutre.

Notre protéine est positive.
C'est ca ? Dites oui, dites oui
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Haterind
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Re: Charge acide aminé

Message par Haterind »

Oui c'est ça tu as le raisonnement!

A un détail près mais c'est en lien avec le tableau, l'histidine est chargé en dessous de son pKa (comme c'est une base ^^). Je te l'ai remis juste en dessous!
Tableau AA fonction ionisable.png
Est ce plus clair ce genre de question à présent? :D
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Si je fais des bêtises vous le saurez pas j'ai un autre pseudo...
le.roi.singe

Re: Charge acide aminé

Message par le.roi.singe »

Haterind a écrit : 31 août 2020, 20:33 [...]
Oui, plus clair, j'ai compris le raisonnement ! Grace à vous ! merci ! (on a vraiment pas le temps en SPR, alors voila... !)

Donc, le tableau d'origine de Samiia était un peu faux ?
Il y a quelque chose qui me chiffonne un peu: dans mon cours, il est indiqué que l'histidine est positif à pH =7, Or, d'après notre tableau, il serait neutre. Pourquoi ? C'est le seul point qui me perturbe.

Sinon, j'ai tout compris le reste.
Puis je avoir un dernier exercice pour la route ? Si je ne vous embete pas bien sur !
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Samiia
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Re: Charge acide aminé

Message par Samiia »

OUPS OUPS OUPS !!

En voulant vite faire, je me suis trompée ! En effet, l'histidine est positive lors que le pH est inf à 6 !!

Dernier exercice pour la route :
Phe - Ser - Asp - His - Lys - Met - Leu - Glu - Val - Gly - Ala - Asp

A pH= 3 s'il te plaît !
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le.roi.singe

Re: Charge acide aminé

Message par le.roi.singe »

Samiia a écrit : 31 août 2020, 21:31 ...
Merci pour l'exercice Samiia, je le ferais demain matin.

Ce qui me chiffonne, c'est que dans le cours, on me dit que l'histidine est positive à pH =7. Cependant, étant basique, on devrait trouver que l'histidine est positive lors que le pH est inf à 6...
C'est contradictoire

PS: c'est génial l'aide qu'on peut trouver ici !
Rulia
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Re: Charge acide aminé

Message par Rulia »

bien le bonsoir :)))

Pour l'histidine retiens bien qu'elle n'est pas chargée à pH 7 (car c'est proche de son pKa égal à 6), je suis désolée dans le poly j'aurais du faire gaffe au titre car il y a écrit "AA basiques, postifis à pH = 7", mais dans la phrase juste en dessous des 3 molécules c'est bien précisé que l'histidine est neutre à pH 7.

La règle énnoncée par ta chère RM chimie O (les AA basiques sont chargés postivement à des pH inférieurs à leur pKa est correcte évidemment mais il fait que cela soit significatif, que la différence soit très nette). Ne t'en fais pas le jour du concours en principe ça ne sera pas trop ambigu et on te demandera souvent à pH 7 donc martèle toi bien le cibouleau avec la neutralité de l'hsitidine à ce pH (et à pH 6 aussi, le prof considère que c'est assez proche).

Hésite pas si tu as d'autres questions qui te trottent dans la tête, sur le forum ou IRL on est là pour toi <333333333 (et tarde pas à aller dodo hein on te surveille)
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Lounes.dah
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Re: Charge acide aminé

Message par Lounes.dah »

Bonsoir bonsoir, juste je met en pièce jointe une image qui peut surement t'aider à comprendre le cas de l'histidine (même si c'est hors cours ça peut aider) et pour retenir que l'histidine est basique malgré que son pka soit à 6 dis toi qu'elle a plusieurs fonctions amines (soit des fonctions à caractère basique)
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le.roi.singe

Re: Charge acide aminé

Message par le.roi.singe »

Samiia a écrit : 31 août 2020, 21:31 Dernier exercice pour la route :
Phe - Ser - Asp - His - Lys - Met - Leu - Glu - Val - Gly - Ala - Asp

A pH= 3 s'il te plaît !
Bonjour Samiia,

Voici ma résolution de l'exercice (en PJ):
Protéine.png
Merci pour l'exercice
Rulia a écrit : 31 août 2020, 22:16 Hésite pas si tu as d'autres questions qui te trottent dans la tête, sur le forum ou IRL on est là pour toi <333333333 (et tarde pas à aller dodo hein on te surveille)
Merci, j'ai pris note de ce que tu as dis.
Je m'étais deja couché à cette heure là hehe !

Merci de votre attention !
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Samiia
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Re: Charge acide aminé

Message par Samiia »

Bonsoir,

La résolution de ton exercice me semble correcte :D Bravo !

A noter que le jour de l'examen tu n'aura pas le tableau, donc soit tu le refait sur ton brouillon, soit tu essayes de trouver une autre méthode !
Et aussi, le jour de l'examen, ils te diront que "His" c'est l'histidine, "Glu" l'acide glutamique, etc ! Donc pas besoin de connaitre ces abréviations !
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Re: Charge acide aminé

Message par le.roi.singe »

Samiia a écrit : 01 septembre 2020, 21:12 ...
Youpi ! j'ai compris grâce à toi ! (et vous aussi les autres tuteurs qui m'ont répondu !)

Oui, en connaissant les pKa et tout ca, je saurai refaire le tableau !
Merci de me l'avoir montré !

A très bientot Samiia et bonne nuit !
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